Research directions
Prise en charge des patients transplantés
Diverses infections virales représentent les causes majeures de morbidité chez les patients transplantés. Des protocoles visant à intégrer les mesures de surveillance microbiologique avec des approches prophylactiques ou thérapeutiques sont développés concernant les virus les plus importants (CMV, EBV) en collaboration avec la Division des Maladies Infectieuses et le Centre de Transplantation d'Organe (CTO). Dans le cadre du projet de lEtude Suisse de Cohorte de Transplantation, cette activité devrait prendre une dimension nationale (P. Meylan)
Développement de vaccins contre les infections par HPV et les cancers de lutérus
Le cancer du col de lutérus est la deuxième cause de mortalité par cancer chez la femme dans le monde. Pratiquement toutes ces tumeurs sont attribuées à une infection par certains types de papillomavirus humains (HPV), dont HPV16 est le plus fréquent. Notre groupe de recherche est impliqué dans le développement de vaccins prophylactiques et thérapeutiques pour prévenir et traiter les infections par HPV16 ainsi que les lésions malignes de la muqueuse génitale qui y sont associées. Nous nous intéressons principalement à des stratégies vaccinales capables dinduire des réponses immunitaires dans les muqueuses génitales et plus particulièrement nous développons des vaccins vivants avec des Salmonella atténuées. Nos projets incluent des études pré-cliniques chez la souris ainsi que des études cliniques chez des volontaires ou des patients (D. Nardelli Haefliger, Département de Gynécologie)
Recherche et développement en diagnostic moléculaire
Le diagnostic moléculaire des infections prend de plus en plus dimportance en clinique et en épidémiologie. Nous mettons au point des méthodes moléculaires basées sur la PCR pour lensemble du spectre des infections microbiologiques. Le choix des méthodes et des cibles prend en compte lautomatisation possible des analyses dans la plateforme de biologie moléculaire, et bien sûr la pertinence clinique des analyses (R. Sahli, K. Jaton, P. Hauser, G. Greub, P. Meylan, A. Telenti, J. Bille)
Champignon pathogène Pneumocystis carinii
Pneumocystis carinii est un champignon microscopique provoquant de graves pneumonies chez les patients immuno-déprimés (transplantation, leucémie, SIDA, etc.). L'utilisation d'antifolates pour la prophylaxie et le traitement de cette infection est corrélée à l'apparition de mutations dans les gènes cibles de ces médicaments. Nous étudions la résistance conférée par ces mutations ainsi que les mécanismes de résistance chez des souches isolées à partir de patients. Nous étudions également l'épidémiologie moléculaire de ce pathogène. Afin d'améliorer les mesures pour prévenir l'infection chez les patients à haut risque, nous recherchons les sources de l'infection (P. Hauser)
Plate-forme de biologie moléculaire
Mise en place dune plate-forme pour le diagnostic microbiologique moléculaire et la recherche fondamentale, utilisant une chaîne automatisée pour la PCR en temps réel et lanalyse de séquençes. Elle permet la réalisation détudes validant lutilité clinique et économique de méthodes de diagnostic moléculaire de certaines pathologies comme la méningite ou la septicémie. Cette plate-forme permet également lanalyse à haut rendement de la susceptibilité génétique de patients vis-à-vis de certaines maladies infectieuses (R. Sahli. K. Jaton, P. Meylan, J. Bille, A. Telenti)
Parachlamydia et autres bactéries associées aux amibes
Etude des relations entre les amibes libres, qui sont largement répandues dans leau et leurs hôtes. Un accent particulier est mis dans létude des interactions de Parachlamydia acanthamoebae avec diverses cellules eucaryotes, dont les macrophages. Le rôle joué en pathologie humaine par ces bactéries intracellulaires obligatoires apparentées aux Chlamydia est également investigué (G. Greub)
Pharmacogénétique des agents antiretroviraux
Etude des les réponses individuelles à la thérapie anti-HIV. Létude cible les gènes du métabolisme et transport des médicaments, polymorphismes génétiques, méthodes de détermination du phénotype et du génotype, et les applications cliniques de la pharmacogénétique dans le domaine VIH (A. Telenti)
Competences
Méthodes de génétique moléculaire
Culture de cellules
Tests immunologiques
Tests antifongiques - tests de virulences sur modèles animaux
Tests antiviraux
Développements de méthodes moléculaires en diagnostic virologique
Tests de diagnostics microbiologiques moléculaires
Biologie cellulaire
Culture d'amibes
PCR en temps réel
Automatisation de méthodes moléculaires
